人类SARS冠状病毒来源于中国南方野生动物市场的果子狸，其所携带的冠状病毒与病人的SARS冠状病毒基因同源性超过99%，近似一样。通过关闭野生动物市场，隔断人与携带冠状病毒的野生动物接触，人类SARS冠状病毒在人类中的传播与爆发很快消失。但进一步调查发现，野生生活的果子狸体内并不存在SARS冠状病毒，而且用病人体内的SARS冠状病毒感染果子狸，它们也会生病。因此，直接传染的果子狸只是SARS病毒的中间宿主，他们也是被别的动物传染。历经多年后，科学家才从云南的中华菊头蝠身上分离出与SARS冠状病毒很相近的病毒Bat SL-CoV Rs3367及Bat SL-CoV SHC014。由于多数蝙蝠都携带这种病毒，蝙蝠本身又没有生病，符合自然宿主的条件。同住一个洞穴的蝙蝠们体内携带很多种病毒，可以互相组合拼接成SARS冠状病毒。